ホテイアオイの異常な増殖はビクトリア湖周辺の人々に多くのマイナス影響を与えます。異常に増殖したホテイアオイがボートの運行を妨げることによる交通や漁業への影響は甚大です。漁業ができなくなると、周辺の人々に経済的な影響があります。また、蚊やその他の害虫が繁殖するため、皮膚の発疹、咳、マラリア、脳炎、ビルハルジア、胃腸障害、および住血吸虫症などが増加します。また、ホテイアオイの異常な増殖は水を脱酸素化させ、水生生物を窒息させます。そして、湖の魚の栄養源を絶ってしまいます。
さらに、ホテイアオイは、水処理や灌漑にも影響を与えるため、周辺地域への水供給が妨げられます。これによって、水力発電所への水供給がブロックされ、周辺都市への電力の遮断につながっています。